MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Coraliomargarita akajimensis DSM 45221 chromosome

Total Repeats: 62253

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014008	CAA	2	6	531	536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294053542
2	NC_014008	CGA	2	6	582	587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294053542
3	NC_014008	GT	3	6	594	599	0 %	50 %	50 %	0 %	294053542
4	NC_014008	AAC	2	6	664	669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294053542
5	NC_014008	CAG	2	6	688	693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294053542
6	NC_014008	CGA	2	6	738	743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294053542
7	NC_014008	CGT	2	6	813	818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294053542
8	NC_014008	ACCG	2	8	819	826	25 %	0 %	25 %	50 %	294053542
9	NC_014008	GC	3	6	832	837	0 %	0 %	50 %	50 %	294053542
10	NC_014008	GGAG	2	8	840	847	25 %	0 %	75 %	0 %	294053542
11	NC_014008	CGT	2	6	865	870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294053542
12	NC_014008	CTC	2	6	874	879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294053542
13	NC_014008	TGG	2	6	908	913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294053542
14	NC_014008	GCC	2	6	937	942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294053542
15	NC_014008	ATGC	2	8	1027	1034	25 %	25 %	25 %	25 %	294053542
16	NC_014008	AAT	2	6	1057	1062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294053542
17	NC_014008	CG	3	6	1117	1122	0 %	0 %	50 %	50 %	294053542
18	NC_014008	TAC	2	6	1156	1161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294053542
19	NC_014008	TGG	2	6	1181	1186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294053542
20	NC_014008	AG	3	6	1212	1217	50 %	0 %	50 %	0 %	294053542
21	NC_014008	AGG	2	6	1223	1228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294053542
22	NC_014008	TTC	2	6	1231	1236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294053542
23	NC_014008	CCGCC	2	10	1290	1299	0 %	0 %	20 %	80 %	294053542
24	NC_014008	AAG	2	6	1405	1410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294053542
25	NC_014008	TGA	2	6	1434	1439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294053542
26	NC_014008	TGA	2	6	1529	1534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294053542
27	NC_014008	TTG	2	6	1567	1572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294053542
28	NC_014008	AGG	2	6	1589	1594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294053542
29	NC_014008	AAG	2	6	1627	1632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294053542
30	NC_014008	TAC	2	6	1642	1647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294053542
31	NC_014008	CGT	2	6	1678	1683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294053542
32	NC_014008	ATCG	2	8	1755	1762	25 %	25 %	25 %	25 %	294053542
33	NC_014008	ATG	2	6	1825	1830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294053542
34	NC_014008	AGC	2	6	1874	1879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294053542
35	NC_014008	GCC	2	6	2069	2074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294053543
36	NC_014008	TCC	2	6	2079	2084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294053543
37	NC_014008	CGTT	2	8	2089	2096	0 %	50 %	25 %	25 %	294053543
38	NC_014008	CGA	2	6	2153	2158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294053543
39	NC_014008	TGC	2	6	2173	2178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294053543
40	NC_014008	GCTG	2	8	2610	2617	0 %	25 %	50 %	25 %	294053544
41	NC_014008	GAG	2	6	2664	2669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294053544
42	NC_014008	TGG	2	6	2707	2712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294053544
43	NC_014008	GAA	2	6	2733	2738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294053544
44	NC_014008	GCAA	2	8	2801	2808	50 %	0 %	25 %	25 %	294053544
45	NC_014008	TGA	2	6	2972	2977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294053544
46	NC_014008	AGA	2	6	2999	3004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294053544
47	NC_014008	CTG	2	6	3036	3041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294053544
48	NC_014008	GAA	2	6	3343	3348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294053545
49	NC_014008	TTG	2	6	3365	3370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294053545
50	NC_014008	CTA	2	6	3409	3414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294053545
51	NC_014008	GAG	2	6	3422	3427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294053545
52	NC_014008	CAA	2	6	3445	3450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294053545
53	NC_014008	ATG	2	6	3471	3476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294053545
54	NC_014008	GAG	2	6	3701	3706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294053545
55	NC_014008	TGA	2	6	3760	3765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294053545
56	NC_014008	GTCG	2	8	3796	3803	0 %	25 %	50 %	25 %	294053545
57	NC_014008	TAC	2	6	3806	3811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294053545
58	NC_014008	GGAT	2	8	3864	3871	25 %	25 %	50 %	0 %	294053545
59	NC_014008	GC	4	8	3876	3883	0 %	0 %	50 %	50 %	294053545
60	NC_014008	ATG	2	6	3924	3929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294053545
61	NC_014008	TGC	2	6	4300	4305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294053546
62	NC_014008	TGG	2	6	4392	4397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294053546
63	NC_014008	GAAT	2	8	4473	4480	50 %	25 %	25 %	0 %	294053546
64	NC_014008	TAG	2	6	4493	4498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294053546
65	NC_014008	GCC	2	6	4549	4554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294053546
66	NC_014008	TTTC	2	8	4575	4582	0 %	75 %	0 %	25 %	294053546
67	NC_014008	CT	3	6	4587	4592	0 %	50 %	0 %	50 %	294053546
68	NC_014008	TGCT	2	8	4714	4721	0 %	50 %	25 %	25 %	294053546
69	NC_014008	CGT	2	6	4724	4729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294053546
70	NC_014008	TCC	2	6	4733	4738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294053546
71	NC_014008	AGTCC	2	10	4755	4764	20 %	20 %	20 %	40 %	294053546
72	NC_014008	GTCG	2	8	4788	4795	0 %	25 %	50 %	25 %	294053546
73	NC_014008	CGC	2	6	4815	4820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294053546
74	NC_014008	CGA	2	6	4836	4841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294053546
75	NC_014008	AC	3	6	4878	4883	50 %	0 %	0 %	50 %	294053546
76	NC_014008	TGC	2	6	5190	5195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294053547
77	NC_014008	TGA	2	6	5280	5285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294053547
78	NC_014008	TGG	2	6	5427	5432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294053547
79	NC_014008	CA	3	6	5456	5461	50 %	0 %	0 %	50 %	294053547
80	NC_014008	TGT	2	6	5465	5470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294053547
81	NC_014008	TCA	2	6	5607	5612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294053547
82	NC_014008	GTC	2	6	5707	5712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294053547
83	NC_014008	TAC	2	6	5730	5735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294053547
84	NC_014008	TCG	2	6	5765	5770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294053547
85	NC_014008	TGA	2	6	5838	5843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294053547
86	NC_014008	TCG	2	6	5888	5893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294053547
87	NC_014008	CATTT	2	10	5917	5926	20 %	60 %	0 %	20 %	294053547
88	NC_014008	CCG	2	6	6026	6031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294053547
89	NC_014008	CAT	2	6	6064	6069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294053547
90	NC_014008	TTC	2	6	6100	6105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294053547
91	NC_014008	ACGCC	2	10	6131	6140	20 %	0 %	20 %	60 %	294053547
92	NC_014008	GAT	2	6	6202	6207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294053547
93	NC_014008	GCT	2	6	6239	6244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294053547
94	NC_014008	TGG	2	6	6306	6311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294053547
95	NC_014008	GCGA	2	8	6343	6350	25 %	0 %	50 %	25 %	294053547
96	NC_014008	AGGT	2	8	6362	6369	25 %	25 %	50 %	0 %	294053547
97	NC_014008	ACCC	2	8	6373	6380	25 %	0 %	0 %	75 %	294053547
98	NC_014008	CCT	2	6	6588	6593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294053547
99	NC_014008	GTCT	2	8	6625	6632	0 %	50 %	25 %	25 %	294053547
100	NC_014008	ATC	2	6	6652	6657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294053547
101	NC_014008	GCT	2	6	6717	6722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294053547
102	NC_014008	TTC	2	6	6730	6735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294053547
103	NC_014008	GGT	2	6	6746	6751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294053547
104	NC_014008	AAT	2	6	6868	6873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294053548
105	NC_014008	A	6	6	6908	6913	100 %	0 %	0 %	0 %	294053548
106	NC_014008	GTG	2	6	7081	7086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294053548
107	NC_014008	AGT	2	6	7169	7174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294053548
108	NC_014008	CCG	2	6	7259	7264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294053549
109	NC_014008	ACG	2	6	7321	7326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294053549
110	NC_014008	GAG	2	6	7371	7376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294053549
111	NC_014008	GTG	2	6	7408	7413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294053549
112	NC_014008	TGCG	2	8	7555	7562	0 %	25 %	50 %	25 %	294053549
113	NC_014008	TG	4	8	7630	7637	0 %	50 %	50 %	0 %	294053549
114	NC_014008	GAT	2	6	7734	7739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294053549
115	NC_014008	GAA	2	6	7860	7865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294053549
116	NC_014008	GAT	2	6	7959	7964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294053549
117	NC_014008	GATT	2	8	8018	8025	25 %	50 %	25 %	0 %	294053549
118	NC_014008	GTTT	2	8	8060	8067	0 %	75 %	25 %	0 %	294053549
119	NC_014008	GGT	2	6	8109	8114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294053549
120	NC_014008	ATG	2	6	8122	8127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294053549
121	NC_014008	GGT	2	6	8145	8150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294053549
122	NC_014008	TTG	2	6	8202	8207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294053549
123	NC_014008	ATTGC	2	10	8248	8257	20 %	40 %	20 %	20 %	294053549
124	NC_014008	GGT	2	6	8265	8270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294053549
125	NC_014008	CGCGG	2	10	8273	8282	0 %	0 %	60 %	40 %	294053549
126	NC_014008	CAG	2	6	8284	8289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294053549
127	NC_014008	GCG	2	6	8301	8306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294053549
128	NC_014008	AGC	2	6	8315	8320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294053549
129	NC_014008	GTG	2	6	8389	8394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294053549
130	NC_014008	GGA	2	6	8420	8425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294053549
131	NC_014008	GCC	2	6	8463	8468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294053549
132	NC_014008	TGAA	2	8	8699	8706	50 %	25 %	25 %	0 %	294053550
133	NC_014008	TCT	2	6	8721	8726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294053550
134	NC_014008	TG	3	6	8733	8738	0 %	50 %	50 %	0 %	294053550
135	NC_014008	GAG	2	6	8786	8791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294053550
136	NC_014008	TGCGC	2	10	8842	8851	0 %	20 %	40 %	40 %	294053550
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138	NC_014008	G	6	6	9045	9050	0 %	0 %	100 %	0 %	294053550
139	NC_014008	TGGT	2	8	9104	9111	0 %	50 %	50 %	0 %	294053550
140	NC_014008	GGA	2	6	9318	9323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294053551
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143	NC_014008	TTGG	2	8	9511	9518	0 %	50 %	50 %	0 %	294053551
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156	NC_014008	TGTC	2	8	9821	9828	0 %	50 %	25 %	25 %	294053552
157	NC_014008	GGC	2	6	9929	9934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294053552
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250	NC_014008	CGTC	2	8	16909	16916	0 %	25 %	25 %	50 %	294053558
251	NC_014008	GAA	2	6	16922	16927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294053558
252	NC_014008	GCT	2	6	17022	17027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294053558
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256	NC_014008	CCT	2	6	17220	17225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294053559
257	NC_014008	TGGC	2	8	17247	17254	0 %	25 %	50 %	25 %	294053559
258	NC_014008	GCC	2	6	17256	17261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294053559
259	NC_014008	TTC	2	6	17277	17282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294053559
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262	NC_014008	GGT	2	6	17438	17443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294053559
263	NC_014008	GCAA	2	8	17458	17465	50 %	0 %	25 %	25 %	294053559
264	NC_014008	GGC	2	6	17513	17518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294053559
265	NC_014008	GAC	2	6	17579	17584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294053559
266	NC_014008	GTGC	2	8	17750	17757	0 %	25 %	50 %	25 %	294053559
267	NC_014008	AGC	2	6	17773	17778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294053559
268	NC_014008	GAA	2	6	18022	18027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294053559
269	NC_014008	GCT	2	6	18061	18066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294053559
270	NC_014008	GTT	2	6	18143	18148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294053559
271	NC_014008	TCG	2	6	18303	18308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294053559
272	NC_014008	GGC	2	6	18373	18378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294053559
273	NC_014008	ATCT	2	8	18386	18393	25 %	50 %	0 %	25 %	294053559
274	NC_014008	ACT	2	6	18450	18455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294053559
275	NC_014008	AGC	2	6	18575	18580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294053559
276	NC_014008	TTGC	2	8	18659	18666	0 %	50 %	25 %	25 %	294053559
277	NC_014008	GGC	2	6	18688	18693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294053559
278	NC_014008	GCT	2	6	18713	18718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294053559
279	NC_014008	CTG	2	6	18729	18734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294053559
280	NC_014008	GACG	2	8	18806	18813	25 %	0 %	50 %	25 %	294053559
281	NC_014008	CAA	2	6	18820	18825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294053559
282	NC_014008	GAT	2	6	18832	18837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294053559
283	NC_014008	CTT	2	6	18973	18978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294053559
284	NC_014008	CAA	2	6	19006	19011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294053559
285	NC_014008	GTG	2	6	19094	19099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294053559
286	NC_014008	CCG	2	6	19206	19211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294053559
287	NC_014008	CGA	2	6	19233	19238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294053559
288	NC_014008	TAC	2	6	19331	19336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294053559
289	NC_014008	AAG	2	6	19337	19342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294053559
290	NC_014008	GAA	2	6	19514	19519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294053559
291	NC_014008	CAG	2	6	19544	19549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294053559
292	NC_014008	GCT	2	6	19575	19580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294053559
293	NC_014008	GTT	2	6	19584	19589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294053559
294	NC_014008	GT	3	6	19594	19599	0 %	50 %	50 %	0 %	294053559
295	NC_014008	TGCC	2	8	19603	19610	0 %	25 %	25 %	50 %	294053559
296	NC_014008	ACA	2	6	19620	19625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294053559
297	NC_014008	CAAG	2	8	19825	19832	50 %	0 %	25 %	25 %	294053559
298	NC_014008	AGA	2	6	20001	20006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294053559
299	NC_014008	GTG	2	6	20031	20036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294053559
300	NC_014008	CCG	2	6	20112	20117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294053559
301	NC_014008	CCAAGG	2	12	20220	20231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294053559
302	NC_014008	ACT	2	6	20244	20249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294053559
303	NC_014008	AACCCG	2	12	20306	20317	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	294053559
304	NC_014008	GGT	2	6	20381	20386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294053559
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313	NC_014008	ATT	2	6	20674	20679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294053560
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344	NC_014008	CGG	2	6	22112	22117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294053561
345	NC_014008	GCG	2	6	22160	22165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294053561
346	NC_014008	TGC	2	6	22168	22173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294053561
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376	NC_014008	GTCT	2	8	23657	23664	0 %	50 %	25 %	25 %	294053563
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378	NC_014008	AC	4	8	23717	23724	50 %	0 %	0 %	50 %	294053563
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380	NC_014008	TTC	2	6	23845	23850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294053563
381	NC_014008	TG	4	8	23891	23898	0 %	50 %	50 %	0 %	294053563
382	NC_014008	AAGC	2	8	23935	23942	50 %	0 %	25 %	25 %	294053563
383	NC_014008	ATG	2	6	23965	23970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294053563
384	NC_014008	TCT	2	6	23984	23989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294053563
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386	NC_014008	AGGC	2	8	24074	24081	25 %	0 %	50 %	25 %	294053563
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388	NC_014008	TCT	2	6	24107	24112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294053563
389	NC_014008	GGT	2	6	24159	24164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294053563
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391	NC_014008	CAT	2	6	24315	24320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294053563
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393	NC_014008	AAG	2	6	24364	24369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294053563
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499	NC_014008	TGA	2	6	30236	30241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294053571
500	NC_014008	GTG	2	6	30290	30295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294053571

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